All functions

ablanor_plot_theme()

Add ablanor theme to ggplot chart

aggreger_ki_prop()

Regn ut Kvalitetsindikator - Andel Funksjon for å regne ut kvalitetsindikatorer for andeler. Tar inn et datasett på 101-format, og returnerer et estimert resultat

app_server()

Server logic for the Ablanor app

app_ui()

Client (ui) for the Ablanor app

def_utledete_var

Utledete variabler

getBasereg() getPros() getMce() getRand12() getFollowupBasis() getFollowupOneYr() getFollowupFiveYr() getGkv() getProms() getHendelse() getFriendlycentre() getMcepatientdata() getPatientlist() getBaseregPros() getLatestEntry() getNameReshId() getHospitalName()

Ablanor SQL

getDataDump()

Get datadump ablanor

getKodebokData()

Behandling av kodeboken (klokeboken) før bruk

getKodebokMedUtledetedVar()

Legg til utledete variabler i kodeboken

getPivotDataSet()

Get selected data set for Pivot Table (Utforsker)

getBaseregData() getProsData() getMceData() getRand12Data() getFollowupBasisData() getFollowupOneYrData() getFollowupFiveYrData() getGkvData() getPromsData() getBaseregProsData() getBaseregProsHendelseData() getBaseregProsFollowup0Data() getBaseregProsFollowup1Data() getBaseregProsFollowup5Data()

Data managment on tables

kbd

Klokeboken data dictionary

ki_akutt_suksess() ki_akutt_suksess_svt() ki_akutt_suksess_svt_avrt() ki_akutt_suksess_svt_avnrt() ki_akutt_suksess_svt_ikkje_avrt_el_avnrt()

Kvalitetsindikatorar for akutt suksess Lag KI-datasett for om ein prosedyre skal reknast som akutt suksess (ja/nei).

ki_dod()

Kvalitetsindikator for død Lag KI-datasett for om pasienten døde innanfor eit visst tal dagar frå prosedyren.

ki_komplikasjonar()

Kvalitetsindikator Kvalitetsindikator for komplikasjoner

ki_komplikasjonar_pacemaker()

Kvalitetsindikator for behov for pacemaker Lag KI-datasett for prosedyrerelatert AV-blokk med behov for etterfølgjande pacemakerimplantasjon (ja/nei).

ki_komplikasjonar_tamponade()

Kvalitetsindikator for tamponade Lag KI-datasett for tamponade som følge av operasjon som fører til intervensjon eller forlenget sykehusopphold.

kodebok_sjekk_foer_leggtil() kodebok_sjekk_foer_fjerning() kodebok_fyll_avkrysningsboks() kodebok_fyll_listetekstvar() kodebok_beholde_bare_listetekstvar()

AblaNor kodebok functions

leggTilTomme_PivotWide()

Utvid og organiser Funksjon som utvider tabellen og legger til alle manglende kombinasjoner av variablene "maned" og "legend". Deretter brukes tidyr::pivot_wider for å få en rad per måned og en kolonne per nivå av faktoren "legend"

legg_til_forlopstype_kortnavn()

Hent kortnavn for forløpstype

legg_til_sykehusnavn()

Add hospital name

mst() mst_short()

Make standard table for rmarkdown reports

make_sorters()

Make sorters for pivot table

reportProcessor()

Common report processor for AblaNor

run_app()

Run the Ablanor Shiny Application

string_pad()

Pad strings with empty spaces to obtain same column width in tables

utlede_alder()

Add variable age (alder)

utlede_alder_75()

Add binary variable alder_75

utlede_aldersklasse()

Add variable aldersklasse

utlede_bmi()

Add variable bmi_manual Add manually calculatet value of Body Mass Index (BMI = weight in kilograms divided by the square of height in meters).

utlede_bmi_klasse()

Add variables bmi_klasse and bmi_over35

utlede_hjertesvikt_redusert_ef()

Hjertesvikt og/eller redusert EF

utlede_kardiomyopati()

VT Kardiomyopati

utlede_kateg_afli_aryt_i48()

Kategori AFLI arytmi i48

utlede_dager_sensur() indik_overlevelse30dg() indik_tamponade() indik_prom_klineff() indik_ferdig_komplik() indik_akuttsuksess() indik_pacemaker() indik_avbrudd()

Kvalitetsindikatorer for AblaNor

utlede_tidsvariabler()

Add tidsvariabler